学院成立以来坚持把学科建设放在重要位置，并加大了建设的力度，学院班子定期召开会议研究学科建设和发展规划，各学科带头人带领大家求真务实、扎实工作，倾注了大量心血和汗水，使学科从无到有，从弱到强，并形成了良好的发展态势。经大家几年的不懈努力和扎实的工作，学科层次逐步提高，学科分布进一步合理，学科实力明显增强。

    在原有“植物学”和“生物化学与分子生物学”硕士点的基础上，于1999年申报成功“发育生物学”硕士点，2002 年报成功“微生物学”硕士点；在原有“植物学”博士点的基础上，于1999年申报成功“生物化学与分子生物学”博士点，于2002 年申报成功“发育生物学”博士点；于2002年建立了“生物学”博士后流动站；2005年，在学校和研究生处的关心支持下，学院精心组织、全力准备，成功申报了“生物学”一级学科博士点。“生物学”一级学科博士点含盖12个二级学科：植物学、动物学、微生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生态学、生理学、遗传学、发育生物学、神经生物学、水生生物学、生物物理学，为推进学院之间、传统学科与现代生物技术之间的融合，提升我校研究生的生源质量和培养水平提供了平台和条件。

    目前我院拥有植物学、生物化学与分子生物学、发育生物学、微生物学、生态学五个博士学位授予点，拥有植物学、生物化学与分子生物学、发育生物学、微生物学、生态学、细胞生物学六个硕士学位授予点，每年的招生规模在80人左右。