地衣研究室建于2003年11月，主要分为地衣标本室、地衣系统学研究室等。现有仪器：体视显微镜、光学显微镜、三用紫外分析仪、超净工作台、冷冻切片机、低温保藏柜、海拔仪、ＧＰＳ、及各用野外采集工具等。所研究方向包括：地衣分类鉴定、地衣区系研究、利用地衣进行大气监测、菌藻分离培养、药用地衣研究及地衣化石的初步研究等。实验室现存许多国内外地衣学方面的文献资料。标本实验室现存采自全国各地的部分标本3000余份。